به گزارش تابناک یزد این مسجد در ضلع شمالی خیابان قیام و در محله دارالشفاء در مجاورت بازار قدیم یزد در مقابل دروازه مهریجرد از دروازه‌های اصلی برج و باروی قدیمی شهر یزد ساخته شده و بانی آن یکی از سرداران ابومسلم خراسانی به نام "احمد بن محمد زمجی" بوده است.
در مسجد فرط، قدمگاهی وجود دارد که حاکی از اقامت حضرت امام رضا(ع) در آنجا می‌کند و سنگ سفید گران قیمت و بسیار معروف قدمگاه اين مسجد از یزد به مشهد رضوی منتقل شده و امروزه به عنوان سنگ قبر امام(ع) در موزه مرکزی آستان قدس مورد بازدید عموم قرار می‌گیرد.
بر طبق کتیبه سنگ مسجد فرط که در سال 516 هجري قمري نوشته شده، محل مسجد به مقام امام رضا(ع) معروف بوده و در این مسجد اتاقی هم به عنوان صومعه امام رضا(ع) وجود دارد.
"محسن ذاكري نيا" معاون ميراث فرهنگي اداره کل میراث‌فرهنگی، صنایع دستی و گردشگری یزد در مورد اين بنا گفت: همجواری اين بناي فرهنگي تاريخي با مجموعه باارزش بازارهای قدیمی و حمام قدیمی مولانا از ديگر شاخصه‌های این بناست.
وي افزود: این بنای مذهبی که دیرینه تاریخی قابل توجهی دارد، دارای سبک معماری ویژه قرون صدر اسلام بوده و الگوهای معین صحن و ایوان را در خود نشان می‌دهد.
به گفته اين مسئول، معماری این مسجد کاملاً همگون با شرایط اقلیمی منطقه وقوع آن است و مصالح مصرفی در بخش قدیمی این مسجد خشت و گل بوده و تزئینات ساده‌ای را دارا است ولی در بخش‌های بازسازی شده تماماً آجر، ملات ریگ و آهک و تزئینات گچ همراه با قاب بندی‌های متناسب را می‌توان مشاهده کرد.
ذاكري‌نيا تصریح کرد: عوامل تزئینی در این عمارت چندان دارای جنبه‌های ظرافت و بدعت نمی‌باشد و اصولاً دارای سادگی و تواضع خاصی است به گونه‌ای که در بدنه‌های حیاط از قاب‌بندی‌های آجر به صورت طاق‌نما با بندکشی گچ بهره جسته‌اند.
وي افزود: در فضاهای داخلی مسجد و شبستان و گرمخانه تا ارتفاع حدود دو متر از بافت آجرچینی ستون‌ها و دیواره‌ها با بندکشی گچ و از آن ارتفاع تا سقف و خود سقف و تویزه‌ها تماماً از اندود گچ استفاده شده است.
ذاکری‌نیا در پایان با بيان اين كه بنای مسجد فرط در سال 1375 با شماره ثبتی 1825 در فهرست آثار ملی ایران به ثبت رسیده است، خاطرنشان كرد: عملیات مرمتی این بنای تاریخی شامل جمع‌آوری آجرفرش های موجود و سبک‌سازی پشت بام، زیرسازی با اندود کاه گل همراه با شیب بندی و نصب ناودان‌های موردنیاز، آجرفرش مجدد پشت بام با آجر فرشی قدیمی به صورت تنگ درز با ملات گل نیمچه کاه، خالی کردن بند آجرهای لبه پشت بام و پادامنه های حیاط و بندکشی مجدد با ملات سیمان سفید و پودر سنگ به پایان رسیده است.